science-reporting-standards
Use when preparing a submission, when a reviewer asks for CONSORT/PRISMA/STROBE/ARRIVE/TRIPOD items, when the journal demands data/code availability statements, or when an audit reports blocking findi
SKILL.mddsh-science/skills/science/science-reporting-standards/SKILL.md
GitHub报告规范:审稿人手里的核对表
先选对规范(选错等于白写)
| 你的研究 | 规范 | 关键条目(缺了必被要求补) |
|---|---|---|
| 随机对照试验 | CONSORT | 注册号、随机化方法与分配隐藏、盲法、主要结局、受试者流程、样本量估算、ITT、不良事件 |
| 系统综述 / meta | PRISMA | 方案预注册(PROSPERO)、数据库与检索式、筛选流程、偏倚风险、异质性、发表偏倚 |
| 队列 / 病例对照 / 横断面 | STROBE | 设计类型、纳排标准、混杂处理、缺失数据、敏感性分析 |
| 动物实验 | ARRIVE 2.0 | 物种品系、饲养条件、人道终点、随机分组(含笼效应)、评估设盲 |
| 预测模型 | TRIPOD | 预测因子定义、区分度与校准、内部/外部验证、EPV 或最小样本量 |
| 质性研究 | COREQ / SRQR | 研究者立场、抽样策略、资料饱和、编码与可信度 |
任何投稿都要有的四段声明
这四段缺失是编辑部最常见的"退回补材料",与学术质量无关但会拖两周:
- Data availability —— 数据在哪、登记号、受控访问条件。不要写"合理请求可提供"。
- Code availability —— 仓库链接 + 版本 tag + 环境文件。
- Competing interests —— 没有也要显式写
The authors declare no competing interests。 - Author contributions —— 用 CRediT 逐人写;通讯作者之外的实质贡献必须列全。
再加三段按情形:Ethics(人/动物必须有批号)、Funding(含资助号)、Acknowledgements。
统计报告:审稿人最先查的五件事
- 精确 n:每组多少、每个图多少。不是"若干"、不是"n≈"。
- 效应量 + 95% CI:只给 p 值等于没给结果大小。p 值与效应量必须同时出现。
- 多重比较:做了几次比较、如何校正(Bonferroni / FDR)、哪些是预设哪些是事后。
- 缺失数据:缺失比例、机制假设、插补方法与完整病例分析的对比。
- 软件与版本:R/Python 版本、包版本、随机种子。
science_paper_audit 的 GEN-05/06/07 就是查前三项。它只能查"有没有",查不出"对不对"——数值合理性要你自己看。
TOP Guidelines 8 项(透明度分级,多数刊已采纳)
- 引用数据/代码 2. 数据可得(含等级) 3. 代码可得 4. 材料可得
- 研究设计预注册 6. 分析计划预注册 7. 分析计划偏离说明 8. 可复现性信息
关键:没有就明说"未预注册"。沉默会被当作隐瞒;明确声明是合规的。
用工具的顺序
science_paper_audit(profiles=["general", <你的设计对应的规范>])
→ 先消 blocking(审稿人必然要求补)
→ 再看 warning(影响送审概率)
→ manual 项自己判断(工具不替你做语义判定)
→ skipped 项不等于通过:补上对应章节再跑一次
绑了 manuscriptId 时会额外检查证据链:孤儿断言(结论没有证据挂接)与被自己的证据反驳的断言。这两类是审稿人最容易击穿的点。
硬规矩
- 不要用"我们遵循了 CONSORT 指南"代替逐项报告。审稿人按条目核对,不看声明。
- 规范文件本身要放进补充材料(尤其 PRISMA 检索式、CONSORT 流程图)。
- 报告规范管的是"有没有报",不是"做得对不对"。设计缺陷补不回来,但漏报可以补。